對于實驗室的工作人員而言，在使用潔凈工作臺時有以下7條注意事項：
事項1：在使用潔凈工作臺前肯定要進行安裝，建議安裝在實驗室內已經隔離好的無塵、無菌區(qū)域，以免灰塵堆積造成過濾器阻塞，從而影響潔凈效果，并縮短設備使用壽命。
事項2：如果是新安裝或長期未使用的潔凈工作臺，在使用前要對工作臺及其周圍用真空吸塵器或不產生纖維的工具進行清潔，再通過紫外線進行處理。
事項3：每次使用潔凈工作臺前，都要先用紫外線滅菌燈照射30-50分鐘，再用75%酒精擦洗臺面，從而消除工作區(qū)內積存的微生物。然后啟動風機運轉2分鐘，隨后才能進行相關實驗操作。
事項4：潔凈工作臺周圍不能存放那些不必要的物品，以免干擾到潔凈氣流流型。
潔凈工作臺
事項5：要注意潔凈工作臺周圍的氣流變化，如果氣流變弱，如酒精燈火焰不動，加大電機電壓情況仍未改變，這說明濾器已阻塞，要及時更換。通常，過濾器3年換1次，要由相關人員來更換。此外，粗過濾器中的過濾布每3-6個月要清洗更換1次。
事項6：當潔凈工作臺使用完畢后，工作人員要及時清理臺面上的物品，并用酒精擦洗臺面，起到清潔的效果。
事項7：要定期對潔凈工作臺進行功能檢測，看看其各項工作指標是否正常。如果不正常，需要及時弄好。